核酸电泳

根据分子量或核酸的结构,Southern和Northern印迹中的电泳涉及从凝胶上(通常是琼脂糖)的样品中分离核酸。

凝胶能够用比如溴化乙锭进行染色并在紫外光下查看,以在进一步处理前检查分离成分的质量和数量。标准分子量Marker经常包含在一个泳道中用以测定分离片段的大小。

DNA

基因组DNA经常用限制性酶切断以得到更小的片段,从而使其能够在凝胶中分开,并且在接下来的印迹步骤中能够容易地从凝胶转移到膜上。DNA也能够在电泳之后被片段化(见印迹)。

RNA

分离经常在含有变性试剂(比如甲醛或乙二醛/DMSO)的凝胶中进行。这限制了二级结构,否则将会妨碍利用片段大小进行的分离。片段化的RNA或microRNAs也可以用聚丙烯酰胺凝胶进行分离,接着进行Northern印迹。


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